Kolekcja rzemiosła artystycznego stanowi trzon wszystkich kwidzyńskich zbiorów. W jej skład wchodzą zabytki związane z historią Powiśla. Część z nich pochodzi z przedwojennego Muzeum Regionalnego Prus Zachodnich w Kwidzynie, a dziś liczy ona ponad 350 obiektów. Tworzą ją przykłady malarstwa portretowego i rodzajowego na czele z dziełami pochodzącymi z dawnych zbiorów hrabiów Sierakowskich z Waplewa Wielkiego oraz grafiki z widokami zamku i katedry w Kwidzynie. Ponadto średniowieczna i nowożytna rzeźba, meblarstwo mieszczańskie, a także naczynia z porcelany i szkła z XVIII–XX wieku. Szczególnie interesującą grupę zabytków stanowią obiekty wykonane z metalu takie jak wyroby złotnicze z końca XVIII i XIX wieku, XVIII-wieczne świeczniki i żyrandole, naczynia cynowe i miedziane, latarnie oraz kute, bogato zdobione wywieszki. Dodatkowo ważną część kolekcji tworzą piece kaflowe z XVIII-XX wieku a także, nieliczne wprawdzie, ale posiadające dużą wartość zabytkową detale architektoniczne pochodzące z zamku i katedry w Kwidzynie oraz innych miejskich budowli.